Vor tausenden von Jahren, als die Menschheit noch jung war, wählte der Erzengel Raziel aus ihrer Mitte jene aus, die er für würdig hielt und mischte sein Blut mit dem ihren. So erschuf er die Rasse der Nephilim, halb Mensch, halb Engel. Sie selbst nennen sich Schattenjäger und leben unebemerkt, aber immer präsent unter uns, als unsere unsichtbaren Beschützer.

Ihre Aufgabe ist es die Welt vor den interdimensionalen Parasiten, den Dämonen zu beschützen, die von Welt zu Welt reisen und auf ihrem Weg Tod und Zerstörung hinterlassen. Auch das Überwachen der Einhaltung der Friedensvertrags, der zwischen dem Rat der Nephilim und den Schattenwesen vor 15 Jahren geschlossen wurde, gehört zu ihren Aufgaben.

Dabei werden sie von den mysteriösen Stillen Brüdern unterstützt, deren Lippen und Augen zugenäht sind. Diese Schattenjäger leben in der City of Bones, der Totenstadt unterhalb Manhattans, wo die toten Schattenjäger ihre letzte Ruhestätte finden. Sie sind Archivare und Hüter der Insignien der Engel. Drei göttliche Objekte, die die Nephilim von Erzengel Raziel einst erhielten: ein Schwert, einen Spiegel und einen Kelch.

Tausende von Jahren hüteten sie diese Insignien, bis der Kreis unter der Führung von Valentin Morgenstern einen Bürgerkrieg anzettelte, der fast die geheime Welt der Schattenjäger zerriss, wobei er versuchte den Rat zustürzen und den Vertrag zwischen den Nephilim und den Schattenwesen zu verhindern. Zwar wurden Valentin und sein Kreis besiegt, doch fehlte danach vom Kelch der Engel jede Spur. Dieser Krieg hinterließ Wunden, die wohl niemals heilen werden.

Doch nun 15 Jahre später, der Vertrag ist gerade neu unterzeichnet worden, kommt es in New York zu unerwarteten Zwischenfällen. Der totgeglaubte Valentin hatte die vergangen Jahre genutzt, um seine Pläne, den Rat zu stürzen und die Schattenwesen zu vernichten, reifen zulassen.
Er ist im Besitz von zwei der drei Insignien, den Kelch der Engel, mit dem er neue Schattenjäger erschaffen kann und dem Schwert, welches er benutzt um ein Dämonenheer zu befehligen. Er scheint mit jedem Tag unbesiegbarer zu werden. Nur wenn die Schattenwesen und die Nephilim zusammen arbeiten, haben sie eine Chance Valentin und sein Heer aus Dämonen zu schlagen.

Doch werden sie es schaffen, ihre jahrhunderte alten Feindschaften zu vergessen?